国税发[2005]9号文件基本规定是：“纳税人取得全年一次性奖金，应单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税”。
年终奖个人所得税计算方式：
1、发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。
2、当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税=(年终奖-(5000-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(5000-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。
这里我们以一个示例进行计算演示：
小王在2013年12月工资6000元，同时领到2013年的年终奖20000元，当月所需缴纳的个人所得税如下：
1)当月工资个人所得税=(6000-5000)*10%-105=0元
2)年终奖个人所得税=20000*10%-105=1895元
当月个人所得税总额=0+1895=1895元
由于单位发放给员工的年终奖形式不同，个人所得税计算方法也不尽相同。
一、员工当月的工资薪金超过「5000」元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。
全年一次性奖金，单独作为一个月计算时，除以12找税率，但计算税额时，速算扣除数只允许扣除一次。
例一：赵某2013年1月工资5000，年终奖24000，无其它收入。
赵某工资部分应缴纳个人所得税：(5000-5000)*3%=0元
赵某年终奖(24000)部分应缴纳个人所得税计算：
先将雇员当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，即：24000/12=2000元，
再按其商数确定适用税率为10%，速算扣除数为105.
赵某年终奖24000应缴纳个人所得税：
24000*10%-105=2295元。
赵某2013年1月份应缴纳个人所得税2295元。
二、员工当月的工资薪金不超过5000元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。
但可以将全年一次性奖金减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，作为应纳税所得额。其中“雇员当月工资薪金所得”以收入额扣除规定标准的免税所得(如按规定缴纳的社会保险和住房公积金等)后的数额。
例二：钱某2013年1月工资2000，年终奖24000，无其它收入。
钱某当月工资2000元，未超过费用扣除标准5000元，不需要缴纳个人所得税。
钱某2013年1月当月工资薪金所得与费用扣除额的差额为5000-2000=3000元。
三、员工一个年度在两个以上单位工作过，只能按照国税发[2005]9号文件规定，在一个纳税年度内，对每一个纳税人年终奖计税办法只允许采用一次，纳税人可以自由选择采用该计税办法的时间和发放单位计算。
该条款的要点是：
1，一个员工2013年1月发放的年终奖适用了除以12找税率的优惠计算政策，2013年其它月份就不能再适用了。
2，一个员工一年一次，在两处以上取得年终奖，也只能适用一次。
3，员工即使工作时间不足12个月，也可以适用一次。
例三：孙某2012年1-3月在石油企业工作，2012年4-8月跳槽到电信企业，2012年9月至今跳槽到房地产企业工作，
如果孙某2012年12月在房地产企业取得工资5000，年终奖24000，其它无收入，虽然钱某只2012年在房地产企业工作4个月，但其应缴纳个人所得税与例一赵某相同，即当月工资部分应缴纳个人所得税45，年终奖部分也是除12找税率，应缴纳个税2295元。
房地产企业计提年终奖时，计提、发放会计处理同例一。
四、员工同一月份在两个以上单位取得年终奖，可以选择一个单位的一次性奖金按照国税发[2005]9号文件优惠办法计算，从另一单位取得的年终奖合并到当月工资薪金项目缴税。
国税发[2005]9号文件规定：“在一个纳税年度内，对每一个纳税人，该计税办法只允许采用一次”。如果同一个人同月在两个企业都取得了年终一次性奖金，纳税人在自行申报时，不可以将这两项奖金合并计算缴纳个人所得税，享受一次性奖金的政策;对该个人按规定只能享受一次全年一次性奖金的优惠算法。
例四：李某2013年1月工资5000，取得本企业发放的年终奖24000元，另取得兼职单位发放的年终奖6000元，无其它收入。
李某本企业年终奖(24000)部分应缴纳个人所得税计算：先将雇员当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，即：24000/12=2000元，
再按其商数确定适用税率为10%，速算扣除数为105.
李某本企业年终奖24000应缴纳个人所得税：
24000*10%-105=2295元。
李某取得的兼职单位发放6000元年终奖应合并到李某当月工资薪金中计算缴纳。如果兼职单位按发放年终奖计算个人所得税，代扣代缴了个人所得税6000*3%=180元。
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